痘疹病变主要发生于鼻镜、鼻孔、唇、齿龈、颊部、乳头、齿板、腹下、腹侧、肠侧和四肢内侧的皮肤等处，也可发生在背部皮肤。死亡猪的9因、口腔、胃和气管常发生疱疹。

由于猪痘的病情比较轻微，组织学病变可见棘细胞肿胀、变性、溶解而出现微细胞化灶，胞核染色质溶解，出现特征性核空泡，当忽视饲养管理时，本病常可继发胃肠炎、肺炎，引起败血症导致死亡。