蛋白质及酶的分子变异体，在同一畜群中有两种或两种以上变异体并存，而稀少的变异体的等位基因频率超过1%的现象。这些变异体是用生物化学方法，主要用电泳技术加以检定，多数情况下，是用淀粉或聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质的电泳方法。电泳分离是根据不同蛋白及酶具有不同的电荷这一事实，将血液放在支持介质上，并置于有相应缓冲液的电场中，蛋白质则向阳极或阴极移动，移动的速度受到本身所带的电荷和电场的强度以及分子的大小和形状影响，因此在电泳移动时即可分离开。用相应的染色剂染色后，即在凝胶上显示出不同区带，这样，分子的变异体即可鉴别出来。这些变异体是受共显性等位基因所控制，因此表现型和基因型是一致的。到目前为止已经在各类家畜的红细胞内部、白细胞内部以及血浆中的多数蛋白和酶发现具有多态性。

红细胞中蛋白及酶多态性 已在牛、猪、绵羊、山羊、马、水牛的红细胞中，发现有20种蛋白和酶具有多态性，各位点的符号以及已承认的等位基因数列于表1。

白细胞中蛋白及酶多态性 已发现牛、马、山羊的白细胞中有10种蛋白及酶具有多态性(表2)。

血浆中蛋白及酶多态性 已在牛、猪、绵羊和马的血浆中发现有15种蛋白及酶具有多态性，各位点的符号及已承认的等位基因数列于表3。

表1 家畜红细胞中蛋白和酶多态性