持久和周期性发生的UTI可能与治疗时不正确使用药物、剂量、用药持续时间有关，这样可能会引起抗生素 的耐受和极差身体顺应性，同时必须再次检测抗生素的敏感性，预测患病动物潜在易感染性的身体状态以降低 对UTI的感染倾向。检查方法有腹部X光检查，静脉内肾盂造影，超声波诊断肾脏、膀胱和前列腺，收集前列腺 分泌物、精液和前列腺洗液进行细胞学检查培养试验。原发的潜在病因，如皮质类固醇治疗、尿结石、息肉和 肿瘤应该尽可能消除。原发潜在病因检查不到，或者检查出来而不能消除时，可采取长期低剂量抗生素治疗。 阉割有助于消除前列腺炎症。患病动物初3～4周应根据抗生素敏感性结果给予足量药物治疗，无效时可在晚上 给予规定日剂量一半的药物，连续治疗至少6个月。长期治疗常成功，发展成持续性感染的情况很少。
无证候性真菌引起的下尿路感染可通过消除易感因素和碱化尿液(pH>7.5)来处理，碱化尿液选用碳酸氢 钠(12mg/kg，口服，每天2次)或者柠檬酸钾(50mg/kg，口服，每天2次)。有症状和肾感染应该用抗真菌药 物，但药物要根据抗真菌药物的敏感性试验来选择。两性霉素B可直接用来冲洗膀胱。氟胞嘧啶50mg/kg，口 服，每天4次有疗效，但会迅速发生真菌的耐药性。氟康唑是人类抗肾脏真菌感染的有效药物，其临床剂量为 200～400mg/d，兽医临床标准剂量尚未确定。
